“二天堂”商号源自明代启蒙读物《幼学琼林》中的两句“感救死之恩，曰再造；诵再生之德，曰二天。”二天堂的前辈创业者，就是怀着这种治病救人，施药济世的慈悲，为病患者重铸第二次生命，再造第二重生天。

清末年间，二天堂在广州一德西路483号开设了店铺。之后，在上海北四川路1315-1317号、以及香港、马来西亚、越南、柬埔寨、印尼、泰国、新加坡等东南亚地区陆续开设分号，都在大门外悬挂起“二分苍生情入药，天道酬勤仁者医”的楹联，寄寓了二天堂人创业以来一直秉承的悲悯情怀。

由于种种难以驾驭的原因，二天堂在上世纪中期开始暂停服务40多年。直至1989年春，第一家分店选址于广州沙河二横路（即沙河电影院对面）重新开业，新的二天堂在秉承先辈的基础上根据社会的需求大幅度调整与拓展公司的业务。同年成立了制药厂和科研中心，为保障药材的选材地道，在四川、云南、广西等地设立自己的中药材基地，种植面积达十几万亩。
    2000年初二天堂获得国家有关部门正式批准成为医药零售连锁企业资格，同年10月25日广州二天堂大药房连锁有限公司注册成立，目前公司旗下在国内拥有二百多家分店，两家网店，五千多平方米的药品配送中心，现有员工一千九百多人，其中具备药师职称的有八百多人，实体店拥有忠实会员70余万人。
    目前二天堂已拥有多家子公司专注于健康、环保、绿色产业的发展，业务遍及科研、制药、批发、医疗、化妆品、中药厂、药膳、中药材养殖基地、餐饮、电子商务等项目，为社会提供更为多元的服务。